Luego de ganar la Copa Águila 2015 y de llegar a cuartos de final (Liga 2015- I) y a dos finales consecutivas bajo la conducción de Alexis Mendoza (Liga 2015-II y Liga 2016-I), Junior bajo la dirección de Giovanni Hernández comprometió su clasificación a los play off de la Liga 2016-II al perder con Once Caldas y acumular su segunda derrota consecutiva en casa y la tercera en línea.
El cuadro barranquillero, desde el momento en que empezó a ponerse al día con las fechas aplazadas del campeonato, resignó puntos importantes en su aspiración de meterse dentro del grupo selecto de quienes disputarán título en el presente semestre.
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Desde el empate ante Jaguares en Montería (0-0); sumando la derrota ante Huila en Tolima (1-3); la derrota en casa ante Fortaleza (1-2); el empate ante Blooming por Copa Sudamericana (1-1) y la reciente pérdida ante Once Caldas (0-1), Junior solo ha podido ganar 2 puntos de 15 en disputa (rendimiento del 13,33℅), recibiendo 7 goles en contra y marcando 3, para una diferencia de menos 4 (promedio de 0,6℅ goles por partido).
A pesar de estar clasificado a octavos de final en Copa Sudamericana y a Semifinal en Copa Águila, el cuadro tiburón ha tenido un desempeño irregular en Liga, donde solo ha ganado 3 partidos (Santa Fe, Alianza y Jaguares de local); ha empatado 5 (Medellín y Rionegro, de local; y Pasto, Tolima y Jaguares de visitante) y ha perdido 3 (ante Huila de visitante y ante Fortaleza y Once Caldas de local), para un rendimiento del 42,42℅
Lo preocupante de la campaña es que el cuadro rojiblanco con 14 puntos en la tabla y con la necesidad de sumar como mínimo 18 más para clasificar, deberá afrontar 9 partidos para lograr su meta de los cuales solo 3 son de local (Millonarios, Envigado y Equidad) y 6 de visitante (Patriotas, Nacional, Chicó, Bucaramanga, Cali y Cortuluá).
En la actualidad Junior marcha en el puesto 15 con 14 puntos y a 4 del octavo que es Caldas, mientras que en la Reclasificación, que otorga un cupo a Copa Libertadores al tercer puesto (Medellín y Nacional ya aseguraron cupo), el cuadro de Barranquilla marcha cuarto con 57 puntos, a cuatro de Millonarios que es tercero con 61.
